Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms