Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUSD1Q6UWL2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms