Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms