Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LETMD1Q6P1Q0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms