Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM69BQ5VUD6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms