Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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VAMP3Q15836 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VAMP3Q15836 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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