Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE4CQ08493 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDE4CQ08493 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms