Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB1P82279 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB1P82279 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB1P82279 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms