Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF3P61204 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF3P61204 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF3P61204 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARF3P61204 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARF3P61204 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARF3P61204 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARF3P61204 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARF3P61204 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARF3P61204 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARF3P61204 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARF3P61204 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARF3P61204 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARF3P61204 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARF3P61204 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARF3P61204 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARF3P61204 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARF3P61204 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARF3P61204 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARF3P61204 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms