Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB1P16220 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CREB1P16220 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREB1P16220 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms