Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP20Q9Y6A4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP20Q9Y6A4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP20Q9Y6A4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP20Q9Y6A4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms