Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX11Q9Y5W9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX11Q9Y5W9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX11Q9Y5W9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms