Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB2Q9Y5E7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB2Q9Y5E7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms