Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HECTD4Q9Y4D8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms