Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FCF1Q9Y324 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FCF1Q9Y324 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms