Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL20Q9Y2M5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL20Q9Y2M5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL20Q9Y2M5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL20Q9Y2M5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms