Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KIAA1024Q9UPX6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA1024Q9UPX6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KIAA1024Q9UPX6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KIAA1024Q9UPX6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms