Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRAK1Q9UPV9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRAK1Q9UPV9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TRAK1Q9UPV9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TRAK1Q9UPV9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRAK1Q9UPV9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRAK1Q9UPV9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRAK1Q9UPV9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRAK1Q9UPV9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRAK1Q9UPV9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRAK1Q9UPV9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TRAK1Q9UPV9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAK1Q9UPV9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAK1Q9UPV9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAK1Q9UPV9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms