Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT6Q9ULM6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNOT6Q9ULM6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNOT6Q9ULM6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms