Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
ZNF608Q9ULD9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC41.66■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
ZNF608Q9ULD9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC41.61■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ZNF608Q9ULD9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ZNF608Q9ULD9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ZNF608Q9ULD9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms