Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP50Q9UKX7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP50Q9UKX7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP50Q9UKX7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms