Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP21Q9UK80 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
USP21Q9UK80 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP21Q9UK80 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP21Q9UK80 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP21Q9UK80 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms