Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX41Q9UJV9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX41Q9UJV9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX41Q9UJV9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX41Q9UJV9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms