Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX25Q9UHL0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DDX25Q9UHL0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX25Q9UHL0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX25Q9UHL0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms