Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
IFT172Q9UG01 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
IFT172Q9UG01 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
IFT172Q9UG01 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
IFT172Q9UG01 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms