Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLN8Q9UBY8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN8Q9UBY8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN8Q9UBY8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN8Q9UBY8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms