Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS7AQ9UBW8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS7AQ9UBW8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COPS7AQ9UBW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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