Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNG4Q9UBN1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNG4Q9UBN1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNG4Q9UBN1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNG4Q9UBN1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms