Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MGAT4CQ9UBM8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MGAT4CQ9UBM8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGAT4CQ9UBM8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms