Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAE1Q9UBE0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAE1Q9UBE0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms