Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ORC3Q9UBD5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ORC3Q9UBD5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ORC3Q9UBD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ORC3Q9UBD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ORC3Q9UBD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ORC3Q9UBD5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ORC3Q9UBD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ORC3Q9UBD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms