Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTN3Q9P232 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CNTN3Q9P232 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNTN3Q9P232 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTN3Q9P232 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms