Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
HMG20BQ9P0W2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HMG20BQ9P0W2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HMG20BQ9P0W2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HMG20BQ9P0W2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms