Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDND1Q9NY35 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDND1Q9NY35 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDND1Q9NY35 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDND1Q9NY35 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.7 ms