Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC39A9Q9NUM3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC39A9Q9NUM3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC39A9Q9NUM3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms