Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL5

RYDEN, Repressor of yield of DENV protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYDENQ9NUL5 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RYDENQ9NUL5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RYDENQ9NUL5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYDENQ9NUL5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RYDENQ9NUL5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RYDENQ9NUL5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms