Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EMILIN3Q9NT22 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
EMILIN3Q9NT22 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EMILIN3Q9NT22 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms