Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPANXA1Q9NS26 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPANXA1Q9NS26 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPANXA1Q9NS26 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms