Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DLL4Q9NR61 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DLL4Q9NR61 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DLL4Q9NR61 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms