Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CYLDQ9NQC7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYLDQ9NQC7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYLDQ9NQC7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYLDQ9NQC7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
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