Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCRT2Q9NQ03 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRT2Q9NQ03 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRT2Q9NQ03 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms