Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE7BQ9NP56 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE7BQ9NP56 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE7BQ9NP56 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE7BQ9NP56 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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