Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
C6orf50Q9HD87 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C6orf50Q9HD87 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C6orf50Q9HD87 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C6orf50Q9HD87 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms