Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4Q9HBW1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC4Q9HBW1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4Q9HBW1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC4Q9HBW1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms