Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMURF2Q9HAU4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMURF2Q9HAU4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMURF2Q9HAU4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms