Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CATSPERBQ9H7T0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CATSPERBQ9H7T0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CATSPERBQ9H7T0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CATSPERBQ9H7T0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms