Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
C11orf49Q9H6J7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.53■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C11orf49Q9H6J7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C11orf49Q9H6J7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C11orf49Q9H6J7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C11orf49Q9H6J7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms