Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XKR8Q9H6D3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XKR8Q9H6D3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XKR8Q9H6D3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XKR8Q9H6D3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XKR8Q9H6D3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XKR8Q9H6D3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XKR8Q9H6D3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XKR8Q9H6D3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
XKR8Q9H6D3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
XKR8Q9H6D3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XKR8Q9H6D3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR8Q9H6D3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR8Q9H6D3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR8Q9H6D3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms