Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J1

ARRDC1-AS1, Uncharacterized protein ARRDC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARRDC1-AS1Q9H2J1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC1-AS1Q9H2J1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms