Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIOBPQ9H2D6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIOBPQ9H2D6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIOBPQ9H2D6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIOBPQ9H2D6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms